MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 76428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015580	CCT	2	6	348	353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139602
2	NC_015580	CGC	2	6	489	494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139602
3	NC_015580	CCG	2	6	519	524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139602
4	NC_015580	TCG	2	6	635	640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139602
5	NC_015580	CTCG	2	8	717	724	0 %	25 %	25 %	50 %	334139602
6	NC_015580	ATC	2	6	859	864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139602
7	NC_015580	TCG	2	6	872	877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139602
8	NC_015580	CGGC	2	8	911	918	0 %	0 %	50 %	50 %	334139602
9	NC_015580	TCG	2	6	1007	1012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139602
10	NC_015580	ATC	2	6	1045	1050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139602
11	NC_015580	GA	3	6	1070	1075	50 %	0 %	50 %	0 %	334139602
12	NC_015580	GCC	2	6	1081	1086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139602
13	NC_015580	CGA	2	6	1122	1127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139602
14	NC_015580	CG	4	8	1149	1156	0 %	0 %	50 %	50 %	334139602
15	NC_015580	CTG	3	9	1198	1206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139602
16	NC_015580	GTC	2	6	1265	1270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139602
17	NC_015580	CTG	2	6	1333	1338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139602
18	NC_015580	ACC	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139603
19	NC_015580	CAT	2	6	1465	1470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139603
20	NC_015580	TCT	2	6	1479	1484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139603
21	NC_015580	TAC	2	6	1514	1519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139603
22	NC_015580	ATC	2	6	1524	1529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139603
23	NC_015580	AGG	2	6	1554	1559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139603
24	NC_015580	ATC	2	6	1595	1600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139603
25	NC_015580	GCTG	2	8	1674	1681	0 %	25 %	50 %	25 %	334139603
26	NC_015580	TCG	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139603
27	NC_015580	GGCT	2	8	1724	1731	0 %	25 %	50 %	25 %	334139603
28	NC_015580	AAG	2	6	1745	1750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139603
29	NC_015580	CTG	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139603
30	NC_015580	TGC	2	6	1816	1821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139603
31	NC_015580	ATC	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139603
32	NC_015580	GTC	2	6	1832	1837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139603
33	NC_015580	TGG	2	6	1839	1844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139603
34	NC_015580	GAA	2	6	2098	2103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139604
35	NC_015580	CGA	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139604
36	NC_015580	GCC	2	6	2169	2174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139604
37	NC_015580	ATC	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139604
38	NC_015580	GAC	2	6	2309	2314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139604
39	NC_015580	TGA	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139604
40	NC_015580	GTG	2	6	2456	2461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139604
41	NC_015580	CGC	2	6	2490	2495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139604
42	NC_015580	CGA	2	6	2503	2508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139604
43	NC_015580	TCG	2	6	2607	2612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
44	NC_015580	CGC	2	6	2613	2618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139604
45	NC_015580	TGC	3	9	2637	2645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
46	NC_015580	CTG	2	6	2690	2695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
47	NC_015580	TGC	2	6	2697	2702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
48	NC_015580	TCG	2	6	2703	2708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
49	NC_015580	GAA	2	6	2720	2725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139604
50	NC_015580	CGA	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139604
51	NC_015580	TCG	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
52	NC_015580	GTC	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
53	NC_015580	CTCGA	2	10	2870	2879	20 %	20 %	20 %	40 %	334139604
54	NC_015580	CTCGG	2	10	2883	2892	0 %	20 %	40 %	40 %	334139604
55	NC_015580	ACA	2	6	2901	2906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139604
56	NC_015580	CGT	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
57	NC_015580	CGG	2	6	2938	2943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139604
58	NC_015580	CTT	2	6	2977	2982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139604
59	NC_015580	CGGCG	2	10	2983	2992	0 %	0 %	60 %	40 %	334139604
60	NC_015580	GAG	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139604
61	NC_015580	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139604
62	NC_015580	ATC	2	6	3023	3028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139604
63	NC_015580	GCT	2	6	3187	3192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139604
64	NC_015580	CGATG	2	10	3259	3268	20 %	20 %	40 %	20 %	334139604
65	NC_015580	CTT	2	6	3313	3318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139604
66	NC_015580	TGA	2	6	3369	3374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139605
67	NC_015580	TTG	2	6	3378	3383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139605
68	NC_015580	GCA	2	6	3418	3423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139605
69	NC_015580	GGC	2	6	3454	3459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139605
70	NC_015580	TGC	2	6	3466	3471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
71	NC_015580	TGA	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139605
72	NC_015580	CTG	3	9	3497	3505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
73	NC_015580	GC	3	6	3531	3536	0 %	0 %	50 %	50 %	334139605
74	NC_015580	GGC	2	6	3538	3543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139605
75	NC_015580	AAG	2	6	3566	3571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139605
76	NC_015580	ATCGGT	2	12	3581	3592	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334139605
77	NC_015580	GCT	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
78	NC_015580	CTG	2	6	3674	3679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
79	NC_015580	GCG	2	6	3735	3740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139605
80	NC_015580	GC	3	6	3872	3877	0 %	0 %	50 %	50 %	334139605
81	NC_015580	TCG	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
82	NC_015580	CTG	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
83	NC_015580	CGT	2	6	3916	3921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139605
84	NC_015580	ATC	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139605
85	NC_015580	GAT	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139605
86	NC_015580	TC	4	8	4062	4069	0 %	50 %	0 %	50 %	334139605
87	NC_015580	CG	3	6	4126	4131	0 %	0 %	50 %	50 %	334139606
88	NC_015580	GGC	2	6	4231	4236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139606
89	NC_015580	TGGCG	2	10	4255	4264	0 %	20 %	60 %	20 %	334139606
90	NC_015580	GCC	2	6	4303	4308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139606
91	NC_015580	CGG	2	6	4333	4338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139606
92	NC_015580	CAT	2	6	4369	4374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139606
93	NC_015580	CGC	3	9	4379	4387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139606
94	NC_015580	AGGC	2	8	4388	4395	25 %	0 %	50 %	25 %	334139606
95	NC_015580	GCA	2	6	4415	4420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139606
96	NC_015580	CGT	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139606
97	NC_015580	AG	3	6	4501	4506	50 %	0 %	50 %	0 %	334139606
98	NC_015580	CGC	2	6	4608	4613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139606
99	NC_015580	GCG	2	6	4706	4711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139606
100	NC_015580	ATG	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139606
101	NC_015580	CCG	2	6	4787	4792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139606
102	NC_015580	TCCG	2	8	4857	4864	0 %	25 %	25 %	50 %	334139606
103	NC_015580	TCG	2	6	4898	4903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139606
104	NC_015580	GTA	2	6	4918	4923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139606
105	NC_015580	TCC	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139606
106	NC_015580	CCA	2	6	5024	5029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139606
107	NC_015580	ATC	2	6	5042	5047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139606
108	NC_015580	CGG	2	6	5097	5102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139607
109	NC_015580	TCG	2	6	5196	5201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139607
110	NC_015580	GTC	2	6	5345	5350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139607
111	NC_015580	CA	3	6	5432	5437	50 %	0 %	0 %	50 %	334139607
112	NC_015580	GC	4	8	5457	5464	0 %	0 %	50 %	50 %	334139607
113	NC_015580	CGA	2	6	5569	5574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139607
114	NC_015580	TGC	2	6	5642	5647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139607
115	NC_015580	CGA	3	9	5671	5679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139607
116	NC_015580	ATC	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139607
117	NC_015580	AGC	2	6	5811	5816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139607
118	NC_015580	GC	3	6	5882	5887	0 %	0 %	50 %	50 %	334139607
119	NC_015580	GCC	2	6	5927	5932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139607
120	NC_015580	CCG	2	6	6081	6086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139607
121	NC_015580	TTG	2	6	6156	6161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139607
122	NC_015580	TCG	2	6	6324	6329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139607
123	NC_015580	GC	4	8	6381	6388	0 %	0 %	50 %	50 %	334139607
124	NC_015580	CGA	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139607
125	NC_015580	CAGC	2	8	6482	6489	25 %	0 %	25 %	50 %	334139607
126	NC_015580	CTGA	2	8	6536	6543	25 %	25 %	25 %	25 %	334139607
127	NC_015580	CAGC	2	8	6608	6615	25 %	0 %	25 %	50 %	334139607
128	NC_015580	GGC	2	6	6617	6622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139607
129	NC_015580	GAA	2	6	6709	6714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139608
130	NC_015580	GTTC	2	8	6722	6729	0 %	50 %	25 %	25 %	334139608
131	NC_015580	GCG	2	6	6776	6781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139608
132	NC_015580	ATC	2	6	6829	6834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139608
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257	NC_015580	GCCAT	2	10	14053	14062	20 %	20 %	20 %	40 %	334139616
258	NC_015580	CAT	3	9	14060	14068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139616
259	NC_015580	GTGCC	2	10	14114	14123	0 %	20 %	40 %	40 %	334139616
260	NC_015580	CGG	2	6	14126	14131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139616
261	NC_015580	GAG	2	6	14133	14138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139616
262	NC_015580	TGC	2	6	14299	14304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139617
263	NC_015580	CGG	2	6	14328	14333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139617
264	NC_015580	GATC	2	8	14373	14380	25 %	25 %	25 %	25 %	334139617
265	NC_015580	CGA	2	6	14400	14405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139617
266	NC_015580	CAC	2	6	14413	14418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139617
267	NC_015580	GAATG	2	10	14530	14539	40 %	20 %	40 %	0 %	334139617
268	NC_015580	TGC	2	6	14592	14597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139617
269	NC_015580	CGG	2	6	14643	14648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139617
270	NC_015580	CGA	2	6	14688	14693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139617
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272	NC_015580	GTC	2	6	14880	14885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139618
273	NC_015580	GGCA	2	8	14948	14955	25 %	0 %	50 %	25 %	334139618
274	NC_015580	CGATCC	2	12	14972	14983	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334139618
275	NC_015580	GAT	2	6	15104	15109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139618
276	NC_015580	GGC	2	6	15171	15176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139618
277	NC_015580	TGA	2	6	15190	15195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139618
278	NC_015580	GAT	2	6	15200	15205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139618
279	NC_015580	CTG	2	6	15249	15254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139618
280	NC_015580	CGA	2	6	15257	15262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139618
281	NC_015580	ACGGCA	2	12	15337	15348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139618
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283	NC_015580	GAA	2	6	15425	15430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139618
284	NC_015580	GCC	2	6	15443	15448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139618
285	NC_015580	CTG	3	9	15474	15482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139618
286	NC_015580	CGGT	2	8	15511	15518	0 %	25 %	50 %	25 %	334139618
287	NC_015580	CCA	2	6	15523	15528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139618
288	NC_015580	GGA	3	9	15548	15556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139618
289	NC_015580	CGC	2	6	15603	15608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139618
290	NC_015580	CGC	2	6	15614	15619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139618
291	NC_015580	ATGGC	2	10	15637	15646	20 %	20 %	40 %	20 %	334139618
292	NC_015580	ACT	2	6	15721	15726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139618
293	NC_015580	GAA	2	6	15776	15781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139618
294	NC_015580	ACG	2	6	15787	15792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139618
295	NC_015580	GGC	2	6	15897	15902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139618
296	NC_015580	CAT	2	6	15905	15910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139618
297	NC_015580	CGCC	2	8	15941	15948	0 %	0 %	25 %	75 %	334139618
298	NC_015580	CGC	2	6	15963	15968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139618
299	NC_015580	CGT	2	6	15986	15991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139618
300	NC_015580	AAGG	2	8	16065	16072	50 %	0 %	50 %	0 %	334139618
301	NC_015580	GC	3	6	16117	16122	0 %	0 %	50 %	50 %	334139618
302	NC_015580	CGA	2	6	16133	16138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139618
303	NC_015580	ACC	2	6	16213	16218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139618
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331	NC_015580	CCTGC	2	10	17258	17267	0 %	20 %	20 %	60 %	334139620
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335	NC_015580	CCGA	2	8	17336	17343	25 %	0 %	25 %	50 %	334139620
336	NC_015580	CGA	2	6	17482	17487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139620
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344	NC_015580	CGA	2	6	17787	17792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139620
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348	NC_015580	GCC	2	6	17972	17977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139620
349	NC_015580	GCT	2	6	18076	18081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139620
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352	NC_015580	GTC	2	6	18257	18262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139621
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362	NC_015580	CGC	2	6	18968	18973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139622
363	NC_015580	CGAT	2	8	19062	19069	25 %	25 %	25 %	25 %	334139622
364	NC_015580	GCA	2	6	19119	19124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139622
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368	NC_015580	TCTT	2	8	19655	19662	0 %	75 %	0 %	25 %	334139623
369	NC_015580	TCCA	2	8	19706	19713	25 %	25 %	0 %	50 %	334139623
370	NC_015580	CGC	2	6	19776	19781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139623
371	NC_015580	TGA	2	6	19803	19808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139623
372	NC_015580	GAC	2	6	19894	19899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139623
373	NC_015580	TCA	2	6	19925	19930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139624
374	NC_015580	GCT	2	6	19950	19955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139624
375	NC_015580	CCG	2	6	19971	19976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139624
376	NC_015580	CGGGG	2	10	20006	20015	0 %	0 %	80 %	20 %	334139624
377	NC_015580	CGG	2	6	20019	20024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139624
378	NC_015580	GC	4	8	20107	20114	0 %	0 %	50 %	50 %	334139624
379	NC_015580	CGGCG	2	10	20330	20339	0 %	0 %	60 %	40 %	334139625
380	NC_015580	CGCCAG	2	12	20342	20353	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334139625
381	NC_015580	CCGGCG	2	12	20358	20369	0 %	0 %	50 %	50 %	334139625
382	NC_015580	GGT	2	6	20449	20454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139625
383	NC_015580	CCG	3	9	20519	20527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139625
384	NC_015580	CG	3	6	20526	20531	0 %	0 %	50 %	50 %	334139625
385	NC_015580	GCT	2	6	20580	20585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139625
386	NC_015580	GGC	2	6	20616	20621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139625
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500	NC_015580	CG	3	6	26370	26375	0 %	0 %	50 %	50 %	334139629

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